Au XIIème siècle, le site de l’actuel Fort Saint Jean à Marseille est concédé à l’Ordre de Malte (alors appelé « Les Hospitaliers de Jérusalem ») qui s’y installe et élève sa commanderie pour acheminer ses troupes vers la Terre Sainte. Il occupe d’abord l’ancienne Chapelle de Saint Jean Baptiste, puis entreprend la construction d’une nouvelle église, d’un hôpital et du Palais du Commandeur. L’ensemble est achevé en 1365.
Le Fort a été restauré notamment afin de s’ouvrir au grand public avec la programmation d’expositions au Musée des Civilisations de l’Europe et de la Méditerranée (MuCEM).
